Johannelund är en högskola som vill ge teologisk utbildning med hög kvalitet. De teologiska programmen syftar till att förbereda kvinnor och män för prästtjänst i
Svenska kyrkan och Evangeliska Fosterlandsstiftelsen, EFS. Johannelund är en av de tre institutioner som ger pastoral profilutbildning till präst i Svenska kyrkan.
Studier vid Johannelund kan också öppna vägar in i andra yrken med teologisk eller religionsvetenskaplig anknytning - i trossamfund, skola och samhälle. Johannelund vill vara en utbildningsmiljö med olika former av mångfald där studerande från olika sociala, kulturella och kyrkliga traditioner kan berika varandra och utbildningen.
De teologiska programmen erbjuder en unik blandning av högskolekurser, pastorala kurser och mentorsgrupper vid Johannelund; kurser vid Uppsala universitet; och en studiemiljö med bibliotek, lunchrestaurang och studenthem på Johannelund. Dessutom har Johannelund ett mångsidigt samarbete med i Lötenkyrkan, en stadsdelskyrka i Gamla Uppsala församling.
Johannelund ger dessutom termins visa bibelskolkurser och andra kurser i samarbete med folkhögskolor, t.ex. kursprogrammet Teologi för livet. Dessa kurser riktar sig till dem som vill utvecklas i sitt församlingsengagemang eller i sitt liv som kristna i familj, yrke och samhälle.